(最終更新日:2024-03-28 14:42:19)
  イケダ マサミ   IKEDA Masami
  池田 修己
   所属   青山学院大学  理工学部 化学・生命科学科
   職種   助教
■ 専門分野及び関連分野
生命・健康・医療情報学, 生物物理学, タンパク質科学, バイオインフォマティクス, バイオデータベース 
■ 学歴・学位
1. 青森公立大学 経営経済学部 経営経済学科 卒業
2. 弘前大学大学院 理学研究科 情報科学専攻 修士課程修了
3. 岩手大学大学院 連合農学研究科 生物資源科学専攻 博士課程修了
4. 岩手大学 博士(農学)
■ 職歴
1. 2004/05~2005/03 独立行政法人産業技術総合研究所 生命情報科学研究センター テクニカルスタッフ
2. 2005/04~2007/03 独立行政法人産業技術総合研究所 生命情報科学研究センター 産総研特別研究員
3. 2007/04~2009/03 早稲田大学 IT研究機構ITバイオ研究所 研究員
4. 2007/04~2009/03 早稲田大学 先端科学・健康医療融合研究機構生命医療工学研究所 客員講師(専任扱い)
5. 2008/04~2016/03 明治大学 理工学部 兼任講師
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■ 所属学会
1. 2000/12~ 日本バイオインフォマティクス学会
2. 2001/10~ 日本生物物理学会
3. 2003/03~ 情報処理学会
■ 
1. 2003/05 社団法人情報処理学会 平成14年度東北支部奨励賞
■ 研究課題・受託研究・科研費
1.   アミノ酸配列情報によるタンパク質構造クラスの判別予測法の開発 個人研究 
2.   バイオインフォマティクス技術を用いたタンパク質の構造・機能予測 個人研究 
3.   膜タンパク質のトポロジー予測法の開発 個人研究 
4.   膜タンパク質の配列─構造情報帰属データベースの構築 個人研究 
■ 研究業績(著書・論文等)
1. 論文  A computational method for detecting GPI-anchored proteins and their GPI modification sites by neural networks Proceedings of the 11th European Conference on Computational Biology (ECCB2012) 121頁 (共著) 2012/09
2. 論文  "A computational identification method for GPI-anchored proteins by artificial neural network" Current Bioinformatics (Bentham Science Publishers) pp.125-131 (共著) 2012/06
3. 論文  "Discrimination of Golgi type II membrane proteins based on their hydropathy profiles and the amino acid propensities of their transmembrane regions" Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry (Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry) pp.82-88 (共著) 2011/01
4. 論文  "A discrimination method for Golgi type II membrane proteins based on the hydropathy alignment and the position-specific score matrix around their transmembrane regions" Proceedings of the 2nd International Conference on Trendz in Information Sciences and Computing (IEEE Xplore) pp.82-87 (共著) 2010/12
5. 論文  "Identification of mammalian GPI-anchored proteins based on amino acid propensities in their GPI attachment signal sequences" Proceedings of the 2nd International Conference on Trendz in Information Sciences and Computing (IEEE Xplore) pp.113-117 (共著) 2010/12
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■ 研究業績(招待講演)
1. 2012/09/19 Computational detection of organelle sorting signals in membrane localized proteins(Sendai)
2. 2005/03/05 『膜タンパク質ドメインデータベースの構築に向けて』(かずさアカデミアホール, 木更津)
■ 研究業績(学会発表)
1. 2012/09/09 A computational method for detecting GPI-anchored proteins and their GPI modification sites by neural networks(11th European Conference on Computational Biology (ECCB2012))
2. 2010/12/06 "Identification of mammalian GPI-anchored proteins based on amino acid propensities in their GPI attachment signal sequences"(2nd International Conference on Trendz in Information Sciences and Computing (TISC2010))
3. 2010/12/06 A discrimination method for golgi type II membrane proteins based on the hydropathy alignment and the position-specific score matrix around their transmembrane regions(2nd International Conference on Trendz in Information Sciences and Computing (TISC2010))
4. 2009/07/04 "Identification of GPI-anchored proteins using position specific score matrix"(34th FEBS Congress)
5. 2009/03/17 『サポートベクターマシンを用いたGPCR-Gタンパク質結合選択性予測法の開発』(電子情報通信学会 2009年総合大会)
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■ 研究業績(取得特許)
1. 2010/07/29 『立体構造データ帰属方法、立体構造データ帰属プログラム及び立体構造データ帰属装置』(共同)(2010-165216)
2. 2010/10/22 『GPIアンカー型タンパク質の判別装置、判別方法及びプログラム』(共同)(4608698)
3. 2012/02/16 『GPIアンカー型タンパク質の判定装置、判定方法及び判定プログラム』(共同)(2012-32163)