イケダ　マサミ   IKEDA Masami   池田　修己    所属   青山学院大学  理工学部 化学・生命科学科    職種   助教
言語種別	英語
発行・発表の年月	2004/02
形態種別	学術雑誌
査読	査読あり
標題	"Proteome-wide classification and identification of mammalian-type GPCRs by binary topology pattern"
執筆形態	共同
掲載誌名	Computational Biology and Chemistry (Elsevier)
巻・号・頁	pp.39-49
著者・共著者	Yasuhito Inoue, Masami Ikeda, Toshio Shimizu
概要	本論文では、Gタンパク質共役型受容体 (GPCR) の候補配列をループの長短の組み合わせを、2ビットのパターン (binary topology pattern) として表現することによって検出する方法を開発した。この方法によって、従来の配列類似性による分類に比べ、GPCRを高精度で分類することができることを明らかにした。さらに、この方法をゲノム配列解読済みの真核生物10種 (208,919 ORFs) に適用し、網羅的にGPCR候補配列 (3,399 ORFs) の検出を行ない、クラス、サブクラス、サブ-サブクラスに分類した。