イケダ　マサミ   IKEDA Masami   池田　修己    所属   青山学院大学  理工学部 化学・生命科学科    職種   助教
言語種別	英語
発行・発表の年月	2003/01
形態種別	学術雑誌
査読	査読あり
標題	"Comprehensive analysis of transmembrane topologies in prokaryotic genomes"
執筆形態	共同
掲載誌名	Gene (Elsevier)
巻・号・頁	pp.77-86
著者・共著者	Masafumi Arai, Masami Ikeda, Toshio Shimizu
概要	本論文では、(1) SOSUIによる水溶性タンパク質か膜タンパク質かの予測判別、(2) DetecSigによるシグナルペプチド配列領域の予測、(3) ConPredによる膜貫通タンパク質に対するトポロジー予測の手順を用いて、ゲノム配列が明らかになった原核生物50種に対して解析を行った。解析の結果、ゲノム中の平均約22%の遺伝子が膜タンパク質をコードしており、このうち13%がシグナルペプチドを持つことが見積もられた。