イケダ マサミ   IKEDA Masami
  池田 修己
   所属   青山学院大学  理工学部 化学・生命科学科
   職種   助教
言語種別 英語
発行・発表の年月 2012/06
形態種別 学術雑誌
査読 査読あり
標題 "A computational identification method for GPI-anchored proteins by artificial neural network"
執筆形態 共同
掲載誌名 Current Bioinformatics (Bentham Science Publishers)
巻・号・頁 pp.125-131
著者・共著者 Yuri Mukai, Hirotaka Tanaka, Masao Yoshizawa, Osamu Oura, Takanori Sasaki, Masami Ikeda
概要 これまでの論文では、哺乳類のGPIアンカー型タンパク質においては糖脂質GPIが修飾される残基付近のアミノ酸出現傾向が重要であることを指摘してきた。本論文では、GPIの修飾を受ける残基付近のアミノ酸組成から算出した位置特異的スコアを、機械学習のひとつである逆誤差伝播型人工ニューラルネットワークに適用させることによって、哺乳類のGPIアンカー型タンパク質を高精度に判別する方法を報告した。